Le musée est situé dans le complexe de l'usine de Santa Ana: la production de céramique à cet endroit a commencé il y a 500 ans et ne s'est arrêtée qu'à la fin du XXe siècle. Les architectes qui ont réalisé non seulement la reconstruction du bâtiment pour les besoins de l'exposition, mais aussi la conception de l'exposition, considèrent leur projet comme une «étape supplémentaire dans l'évolution» de cette fabrication.
8 fours, un puits, des moulins pour la fabrication de peintures, des ateliers et des magasins ont survécu de l'usine en fonctionnement. Au cours des découvertes archéologiques, il a été possible de trouver les restes de 8 autres fours, dont les plus anciens n'étaient plus utilisés à la fin du XVIe siècle.
Les architectes n'ont pas voulu «déclarer» quoi que ce soit avec leur projet, mais ont seulement essayé de s'inscrire dans le contexte historique: par exemple, leur travail ne se manifeste en aucune façon sur les façades du bâtiment.
Au cours des siècles de travail actif, la manufacture a été à plusieurs reprises reconstruite, rénovée et agrandie, et aujourd'hui son complexe est une mosaïque chaotique de fragments d'époques différentes. Avec l'aide des dernières méthodes archéologiques, il a été possible de préserver non seulement ce désordre, mais même la suie et les cendres des siècles passés.
Le premier étage du bâtiment est organisé autour des fours, ce qui rend l'espace labyrinthique; il décrit le processus traditionnel de fabrication de la céramique. Les salles d'exposition au deuxième étage sont situées autour du patio. Les façades de cette partie du bâtiment sont protégées du soleil par des tubes en céramique produits localement: c'est à la fois une référence au thème du musée et un moyen de mettre en valeur visuellement la dernière couche du «palimpseste» architectural.
