La structure en cinq sections rappelle les œuvres de MVRDV telles que la Celosia de Madrid et le Parkrand d'Amsterdam: son volume est traversé par d'énormes arcs, et la «cour» formée par ces ouvertures est élevée au-dessus du sol. Le complexe est situé sur le territoire du nouveau quartier de Lyon-Cofluence, une ancienne zone industrielle de la presqu'île de Perrache en plein centre de la ville (Perrache est formée par les rivières Rhône et Sona qui se connectent à cet endroit).
Le Monolithe dispose de 32 500 m2 d'espace utilisable, qui abrite des logements sociaux et locatifs, des logements pour personnes handicapées, des bureaux et des commerces. Parmi les participants au projet figurent Eric van Egeraat, Manuel Gautrand, Pierre Gautier, bureau ECDM. Les espaces publics sont gérés par West 8.
Chacune des sections diffère par la fonction et la solution de la façade, y compris le matériau utilisé. La façade principale sud, appartenant à la section de travail du MVRDV, donne sur le remblai. Le revêtement en aluminium est également utilisé pour les volets pour protéger l'intérieur des rayons du soleil (c'est aussi une référence à la tradition locale).
Lorsque tous les volets sont fermés, le texte du 2e article de la Constitution européenne peut être lu sur la façade (selon le traité de Lisbonne, ces mots sont désormais inclus dans la Charte des droits de l'homme de l'UE): «L'Union est basée sur les valeurs de respect de la dignité humaine, de la liberté, de la démocratie, de l'égalité, du droit de la suprématie et du respect des droits de l'homme, y compris les droits des minorités. Ces valeurs sont communes aux Etats membres dans une société où le pluralisme, la non-discrimination, la tolérance, la solidarité et l'égalité entre les femmes et les hommes ont triomphé. Les architectes ont décidé de placer ce texte en façade en 2005 lorsqu'il leur est apparu clairement que la Constitution européenne ne serait pas adoptée (la France et les Pays-Bas ont alors refusé de la ratifier).
Le projet est devenu une plateforme pertinente pour exprimer son soutien à l'idée d'une Europe unie, puisque les Néerlandais et les Français y ont travaillé en même temps, et 150 hectares de Lyon Confluence auraient été impossibles à développer sans l'aide de la Commission européenne.
Le Monolithe est un bâtiment économe en énergie et répond à la norme française de construction écologique Haute Qualité Environnementale (HQE). Il dispose d'une isolation renforcée et d'un système de récupération des eaux pluviales; 80% de l'énergie consommée provient de sources renouvelables. L'aménagement offre lumière naturelle et ventilation, confort thermique et acoustique. Technologie de conservation de la chaleur utilisée, panneaux solaires, double vitrage amélioré.
