Le musée, qui contient les célèbres écrans jumeaux "Iris" de l'artiste du 17ème siècle Ogata Korin, ainsi qu'une variété de peintures, de sculptures et d'artisanat du Japon, de Chine et de Corée, est situé sur le territoire d'un ancien manoir de la ville près du boulevard animé d'Omotesando.
Le but de la reconstruction était de créer un sentiment de «wa» - «harmonie japonaise» pour le visiteur. La tâche pratique de Kuma était de préserver le caractère isolé et fermé du complexe, tout en suivant les principes de l'architecture japonaise. Le projet qui en résulte combine les éléments individuels et les principes généraux de l'architecture traditionnelle avec le langage du modernisme, qui simplifie et caractérise les détails et les formes.
Le bâtiment sous un toit à pignon lourd, avec des appuis verticaux accentués, a acquis presque entièrement des murs en verre - c'est à la fois un hommage au 21ème siècle, et un reflet de la "perméabilité" d'une maison japonaise traditionnelle, son lien étroit avec la nature environnante (dans ce cas, avec le jardin). Le bambou est largement utilisé - des murs et plafonds extérieurs aux bancs et aux casiers dans la salle de stockage.
Si le bâtiment principal a été reconstruit et doublé de taille, le café du musée a été entièrement reconstruit. Dans ce petit bâtiment, Kuma a utilisé le verre et le papier huilé comme matériaux principaux, réunissant modernité et tradition.
